Grupo Rodríguez Seguí – IFIBYNE – CONICET

Area de estudio

Regulación génica durante el desarrollo y regeneración de las células beta pancreáticas

Dr. Santiago Rodríguez Seguí
JEFE DE GRUPO – @RSeguiLab

Investigador Independiente CONICET

Jefe de Trabajos Prácticos, Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular, FCEN, UBA.

Línea de Investigación:

Vías de señalización y mecanismos epigenéticos en el control de la diferenciación y regeneración de las células beta pancreáticas

La patología diabética se asocia con la muerte o mal funcionamiento de las células beta productoras de insulina del páncreas. Estudios recientes han demostrado una insospechada capacidad de regeneración del páncreas adulto en roedores, siendo capaces de revertir el estadio diabético en respuesta al daño tisular. Nuestro laboratorio estudia los mecanismos moleculares involucrados en el control de la generación y regeneración de las células beta pancreáticas. A estos fines integramos el análisis bioinformático de datos epigenómicos (ChIP-seq) y transcriptómicos (RNA-seq) obtenidos en muestras pancreáticas humanas, de rata y de ratón, con la validación experimental en modelos biológicos apropiados. Usando este enfoque, reportamos previamente que las proteínas TEAD y YAP regulan la red de regiones regulatorias distales del genoma (o enhancers, por su término en inglés) que está activa durante el desarrollo pancreático en humanos. Actualmente estamos estudiando como los glucocorticoides podrían interferir con este mecanismo. Por otro lado, nuestros resultados mas recientes están orientados al estudio de los mecanismos involucrados en la regeneración de células beta en roedores, poniendo en un plano central a la proteína INGAP ( “Islet Neogenesis Associated Protein”) y a un potencial rol del sistema inmune en este proceso.

Actividades Bariloche 2019

Simposio SISTAM

Publicaciones

Romero, A.*, Heidenreich, A.C.*, Roman, C.L., Algañarás, M., Nazer, E., Gagliardino, J.J., Maiztegui, B., Flores, L.E., and Rodríguez-Seguí, S.A.^† Transcriptional signature of islet neogenesis-associated protein peptide-treated rat pancreatic islets reveals induction of novel long non-coding RNAs. Front. Endocrinol 2023, 14, 1226615. * equal first author contribution. ^† corresponding author. https://doi.org/10.3389/fendo.2023.1226615

Burgos, J.I., Vallier, L.^†, and Rodríguez-Seguí, S.A.^† Monogenic Diabetes Modeling: In Vitro Pancreatic Differentiation From Human Pluripotent Stem Cells Gains Momentum. Front Endocrinol 2021, 12, 692596 (Review). ^† co-senior authorship. https://doi.org/10.3389/fendo.2021.692596

El-Khairi, R., Olszanowski, E., Muraro, D., Madrigal, P., Tilgner, K., Chhatriwala, M., Vyas, S., Chia, C.Y., Vallier, L.^†, Rodríguez-Seguí, S.A.^†. Modelling HNF1B-associated monogenic diabetes using human iPSCs reveals an early stage impairment of the pancreatic developmental program. Stem Cell Reports 2021, 16(9):2289-2304. ^† co-senior authorship. https://doi.org/10.1016/j.stemcr.2021.07.018

Oropeza, D.*, Cigliola1, V.*, Romero, A.*, Chera, S., Rodríguez-Seguí, S.A.^†, Herrera, P.L.^†. Stage-specific transcriptomic changes in pancreatic α-cells after massive β-cell loss. BMC Genomics. BMC Genomics 2021, 22, 585. * equal first author contribution. ^† co-senior authorship. https://doi.org/10.1186/s12864-021-07812-x

Gómez Acuña, L.I., Nazer, E.*, Rodríguez-Seguí, S.A.*, Pozzi, B., Buggiano, V., Marasco L.E., Agirre, E., He, C., Alló, M., Kornblihtt, A.R. Nuclear Role for Human Argonaute-1 as an Estrogen-dependent Transcription Coactivator. Journal of Cell Biology 2020, 219 (9): e201908097. * equal contribution. https://doi.org/10.1083/jcb.201908097

Ogara, M.F., Rodríguez-Seguí, S.A.*, Marini, M.*, Nacht, A.S., Stortz, M., Levi, V., Presman, D.M., Vicent, G.P., Pecci, A. The glucocorticoid receptor interferes with progesterone receptor-dependent genomic regulation in breast cancer cells. NAR 2019, 47(20), 10645–10661. * equal contribution. https://doi.org/10.1093/nar/gkz857

Zubeldía-Brenner, L., De Winne^,C., Perrone, S., Rodríguez-Seguí, S.A., Willems, C., Ornstein, A.M., Lacau-Mengido, I., Vankelecom, H., Carolina, C., Becu-Villalobos, D. Inhibition of Notch signaling attenuates pituitary adenoma growth in Nude mice. Endocrine-Related Cancer 2019, 26, 13–29. https://doi.org/10.1530/erc-18-0337

Cebola, I.*, Rodríguez-Seguí, S.A.*, Cho, C.H.-H.*, Bessa, J.*, Rovira, M.*, Luengo, M., Chhatriwala, M., Berry, A., Ponsa-Cobas, J., Maestro, M.A., Jennings, R.E., Pasquali, L., Morán, I., Castro, N., Hanley, N., Gomez Skarmeta, J.L., Vallier, L., Ferrer, J. TEAD and YAP regulate the enhancer network of human embryonic pancreatic progenitors. Nature Cell Biology 2015, 17, 615-626. * equal contribution. https://doi.org/10.1038/ncb3160

Moiola, C.P., De Luca, P., Zalazar, F., Cotignola, J., Rodríguez-Seguí, S.A., Gardner, K., Meiss, R., Vallecorsa, P., Pignataro, O.,Mazza, O., Vazquez, E.S., De Siervi, A. Prostate tumor growth is impaired by CtBP1 depletion in high-fat diet-fed mice. Clinical Cancer Research 2014, 20, 4086-4095. https://doi.org/10.1158/1078-0432.ccr-14-0322

Pasquali, L.*, Gaulton, K.*, Rodríguez-Seguí, S.A.*, Mularoni, L., Miguel-Escalada, I., Akerman, I., Tena, J.J., Morán, I., Gómez-Marín, C., van de Bunt, M., Ponsa-Cobas, J., Castro, N., Nammo, T., Cebola, I., García-Hurtado, J., Maestro, M.A., Pattou, F., Piemonti, L., Berney, T., Gloyn, A., Ravassard, P., Gomez Skarmeta, J.L., Müller, F., McCarthy, M.I., Ferrer, J. Pancreatic islet enhancer clusters enriched in type 2 diabetes risk-associated variants. Nature Genetics 2014, 46, 136-143. * equal contribution. https://doi.org/10.1038/ng.2870

Weedon, M.N., Cebola, I., Patch, A.M., Flanagan, S., De Franco, E., Caswell, R., Rodríguez-Seguí, S.A., Shaw-Smith, C., Cho, C., Allen, H.L., Houghton, J., Roth, C.L., Chen, R., Hussain, K., Marsh, P., Vallier, L., Murray, A., International Pancreatic Agenesis Consortium, Ellard, S., Ferrer, J., Hattersley, A.T., Recessive mutations in a distal PTF1A enhancer cause isolated pancreatic agenesis. Nature Genetics 2014, 46, 61-64. https://doi.org/10.1038/ng.2826

Rodríguez-Seguí, S.A., Ortuño, M.J., Ventura, F., Martínez, E., Samitier, J., Simplified microenvironments and reduced cell culture size influence the cell differentiation outcome in cellular microarrays. Journal of Materials Science-Materials in Medicine 2013, 24, 189-198. https://doi.org/10.1007/s10856-012-4785-1

Morán, I., Akerman, I., van de Bunt, M., Xie, R., Benazra, M., Nammo, T., Arnes, L., Nakic, N., García-Hurtado, J., Rodríguez-Seguí, S., Pasquali, L., Sauty-Colace, C., Beucher, A., Scharfmann, R., van Arensbergen, J., Johnson, P.R., Berry, A., Lee, C., Harkins, T., Gmyr, V., Pattou, F., Kerr-Conte, J., Piemonti, L., Berney, T., Hanley, N., Gloyn, A.N., Sussel, L., Langman, L., Brayman, K. L., Sander, M., McCarthy, M.I., Ravassard, P., Ferrer, J. Human beta Cell Transcriptome Analysis Uncovers lncRNAs That Are Tissue-Specific, Dynamically Regulated, and Abnormally Expressed in Type 2 Diabetes. Cell Metabolism 2012, 16, 435-448. https://doi.org/10.1016/j.cmet.2012.08.010

Rodríguez-Seguí, S. A., Pons Ximénez, J. I., Sevilla, L., Ruiz, A., Colpo, P., Rossi, F., Martínez, E., Samitier, J., Immobilized protein quantification and comparison in substrates for cellular microarray applications. Journal of Biomedical Materials Research: Part A 2011, 98A, (2), 245-256. https://doi.org/10.1002/jbm.a.33089

Rodríguez-Seguí, S.A., Bucior, I., Burger, M.M., Errachid, A., Fernàndez-Busquets, X. Application of the Quartz Crystal Microbalance to the Study of Multivalent Carbohydrate-Carbohydrate Adhesion. Sensor Letters 2009, 7, (5), 782-787. https://doi.org/10.1166/sl.2009.1148

Rodríguez-Seguí, S.A., Pla-Roca, M., Engel, E., Planell, J.A., Martínez, E., Samitier, J., Influence of fabrication parameters in cellular microarrays for stem cell studies. Journal of Materials Science-Materials in Medicine 2009, 20, (7), 1525-1533.https://doi.org/10.1007/s10856-009-3716-2

Subsidios

Royal Society International Exchanges Award 2022. Characterization of novel human pancreatic progenitor cell type markers with potential roles in beta-cell genesis. PI: Dr. Santiago A. Rodríguez Seguí (CONICET), Dr. Rachel Jennings (University of Manchester, UK).

Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica, Ministerio de Ciencia y Tecnología, Argentina (PICT 2021-00073). Generation and regeneration of pancreatic β cells: GPCR signalling and mechanisms mediated by Gαs. PI: Dr. Santiago A. Rodríguez Seguí

Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica, Ministerio de Ciencia y Tecnología, Argentina (PICT 2019-00374). Glucocorticoid receptor role in pancreatic progenitor cell development and β cell genesis. PI: Dr. Santiago A. Rodríguez Seguí

International Cooperation CONICET-Royal Society 2018: Study of the Glucocorticoid Receptor role in pancreatic progenitor cell differentiation and β cell genesis. PI: Dr. Santiago A. Rodríguez Seguí (CONICET), Dr. Ludovic Vallier (Sanger Institute, UK).

Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica, Ministerio de Ciencia y Tecnología, Argentina (PICT 2017–2071). β cell neogenesis: mechanisms and contribution from pancreatic and non-pancreatic cell types. PI: Dr. Santiago A. Rodríguez Seguí

Universidad de Buenos Aires (Project 20020170200156BA, UBACyT 2017). Epigenetic mechanisms in control of β cell development and differentiation mediated by the glucocorticoid receptor. PI: Dr. Santiago A. Rodríguez Seguí

International Cooperation CONICET-NIH: Mechanisms of genomic regulation involved in the control the beta cell mass by glucocorticoids during pancreas development. PI: Dr. Santiago A. Rodríguez Seguí, Dr. Silvio Gutkind (UCSD, USA)

Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica, Ministerio de Ciencia y Tecnología, Argentina (PICT 2015–3605). Epigenetic mechanisms in control of pancreatic beta cell development and differentiation. PI: Dr. Santiago A. Rodríguez Seguí

Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica, Ministerio de Ciencia y Tecnología, Argentina (PICT 2014–2814). INGAP and the control of beta cell mass and function: transcriptional and epigenomic effects. PI: Dr. Santiago A. Rodríguez Seguí

Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica, Ministerio de Ciencia y Tecnología, Argentina (PICT 2013–0310). Mechanisms of genomic regulation involved in the control the beta cell mass by glucocorticoids during pancreas development. PI: Dr. Santiago A. Rodríguez Seguí

Noticias / Medios

Buscamos investigador/a postdoctoral para sumarse a nuestro grupo de trabajo en el IFIBYNE-UBA-CONICET (Beca postdoctoral Agencia ya aprobada). Tema: epigenética, bioinformática y diabetes.

Nota radial para el programa Ciencia del Fin del Mundo (2023). “Descubren nuevos genes a partir del estudio de una molécula capaz de regenerar las células productoras de insulina“. https://open.spotify.com/episode/6UPOFORjtPuhJvn9sxyD7G?si=e7d207be415b47e6

Nota radial para el programa La Ciencia y la Salud (2021). “Investigan un mecanismo de regeneración de las células productoras de insulina”. https://m.soundcloud.com/fundacionmedife/dr-santiago-rodriguez-segui

Nota en CONICET (2021). “Investigan un mecanismo de regeneración de las células productoras de insulina”. https://www.conicet.gov.ar/investigan-un-mecanismo-de-regeneracion-de-las-celulas-productoras-de-insulina/

Declaración de interés del Honorable Senado de la Nación Argentina (2021) por el trabajo de investigación respecto de un mecanismo de regeneración de las células productoras de insulina. https://www.senado.gob.ar/parlamentario/comisiones/verExp/2321.21/S/PD

Revista Genética Médica (2015). “Un estudio revela interruptores del genoma que activan el desarrollo embrionario del páncreas humano”. https://genotipia.com/genetica_medica_news/desarrollo-del-pancreas-humano/