Los individuos de una misma especie muestran variabilidad genética entre ellos, la gran mayoría ubicada en regiones no codificantes. En muchos casos estas variantes pueden afectar elementos regulatorios, tales como promotores, enhancers o genes de RNA no codificantes. Voy a contar sobre el trabajo que realizamos en Drosphila melanogaster para entender como la variabilidad genética afecta la regulación de la expresión génica durante el desarrollo embrionario. Utilizando la técnica de CAGE para medir el uso de sitios de inicio de transcripción en 80 líneas endocriadas, combinada con métodos analíticos para encontrar variantes asociadas a diferentes efectos transcripcionales, logramos revelar una gran prevalencia de variantes funcionales en los promotores de los genes. También contaré los esfuerzos para caracterizar el repertorio de RNAs no codificantes transcriptos durante la embriogénesis, sus posibles roles y su variabilidad. Finalmente contaré las líneas de trabajo que actualmente estamos comenzando en el laboratorio para investigar la relevancia de estos conceptos en sistemas tales como la diferenciación celular y el cáncer.